Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPNQ5VXI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPNQ5VXI9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms