Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2LQ5T4T6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2LQ5T4T6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms