Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSL3PQ5NE16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSL3PQ5NE16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSL3PQ5NE16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSL3PQ5NE16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSL3PQ5NE16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms