Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC23Q53EV4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC23Q53EV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC23Q53EV4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms