Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF3Q3KNV8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF3Q3KNV8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms