Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HFEQ30201 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HFEQ30201 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HFEQ30201 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HFEQ30201 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HFEQ30201 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HFEQ30201 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HFEQ30201 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HFEQ30201 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HFEQ30201 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HFEQ30201 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HFEQ30201 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HFEQ30201 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HFEQ30201 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HFEQ30201 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HFEQ30201 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HFEQ30201 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HFEQ30201 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HFEQ30201 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HFEQ30201 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HFEQ30201 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HFEQ30201 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HFEQ30201 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HFEQ30201 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HFEQ30201 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HFEQ30201 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HFEQ30201 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HFEQ30201 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HFEQ30201 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HFEQ30201 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HFEQ30201 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HFEQ30201 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HFEQ30201 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HFEQ30201 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HFEQ30201 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HFEQ30201 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HFEQ30201 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HFEQ30201 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HFEQ30201 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HFEQ30201 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HFEQ30201 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HFEQ30201 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HFEQ30201 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HFEQ30201 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HFEQ30201 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HFEQ30201 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HFEQ30201 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HFEQ30201 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HFEQ30201 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HFEQ30201 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HFEQ30201 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HFEQ30201 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HFEQ30201 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HFEQ30201 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HFEQ30201 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HFEQ30201 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HFEQ30201 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HFEQ30201 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HFEQ30201 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HFEQ30201 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HFEQ30201 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HFEQ30201 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HFEQ30201 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HFEQ30201 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HFEQ30201 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HFEQ30201 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HFEQ30201 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HFEQ30201 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HFEQ30201 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HFEQ30201 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HFEQ30201 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HFEQ30201 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HFEQ30201 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HFEQ30201 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HFEQ30201 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HFEQ30201 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HFEQ30201 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HFEQ30201 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HFEQ30201 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HFEQ30201 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HFEQ30201 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HFEQ30201 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HFEQ30201 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HFEQ30201 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HFEQ30201 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms