Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTU2Q2VPK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU2Q2VPK5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU2Q2VPK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU2Q2VPK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
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