Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSG1Q2KHT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSG1Q2KHT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms