Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NREPQ16612 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NREPQ16612 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NREPQ16612 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NREPQ16612 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NREPQ16612 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NREPQ16612 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NREPQ16612 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NREPQ16612 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NREPQ16612 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NREPQ16612 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NREPQ16612 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NREPQ16612 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NREPQ16612 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NREPQ16612 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NREPQ16612 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NREPQ16612 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NREPQ16612 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NREPQ16612 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NREPQ16612 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NREPQ16612 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NREPQ16612 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NREPQ16612 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NREPQ16612 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NREPQ16612 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NREPQ16612 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NREPQ16612 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NREPQ16612 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NREPQ16612 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NREPQ16612 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NREPQ16612 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NREPQ16612 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NREPQ16612 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NREPQ16612 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NREPQ16612 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NREPQ16612 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NREPQ16612 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NREPQ16612 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NREPQ16612 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms