Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC6Q16204 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC6Q16204 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC6Q16204 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
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