Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R1Q15078 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R1Q15078 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R1Q15078 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R1Q15078 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5R1Q15078 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5R1Q15078 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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