Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKP2Q13309 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SKP2Q13309 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP2Q13309 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP2Q13309 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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