Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDNQ13061 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRDNQ13061 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRDNQ13061 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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