Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP1Q12981 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BNIP1Q12981 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP1Q12981 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP1Q12981 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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