Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F3Q08477 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F3Q08477 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP4F3Q08477 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.2 ms