Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCNT1Q02742 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GCNT1Q02742 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCNT1Q02742 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCNT1Q02742 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms