Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR2Q01850 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR2Q01850 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDR2Q01850 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDR2Q01850 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDR2Q01850 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms