Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC5Q00444 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC5Q00444 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HOXC5Q00444 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms