Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL13RA1P78552 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL13RA1P78552 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL13RA1P78552 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IL13RA1P78552 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL13RA1P78552 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL13RA1P78552 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL13RA1P78552 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL13RA1P78552 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms