Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSNL1P62760 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSNL1P62760 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSNL1P62760 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
VSNL1P62760 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms