Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVS71-1P61550 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVS71-1P61550 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVS71-1P61550 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms