Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00205P59089 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00205P59089 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00205P59089 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms