Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRYBA4P53673 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRYBA4P53673 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRYBA4P53673 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms