Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP5CP53041 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP5CP53041 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP5CP53041 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP5CP53041 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP5CP53041 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms