Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1A2P50993 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1A2P50993 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A2P50993 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATP1A2P50993 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP1A2P50993 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP1A2P50993 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms