Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPT1P50897 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPT1P50897 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPT1P50897 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPT1P50897 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPT1P50897 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPT1P50897 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPT1P50897 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPT1P50897 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPT1P50897 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPT1P50897 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPT1P50897 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPT1P50897 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPT1P50897 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPT1P50897 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPT1P50897 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPT1P50897 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPT1P50897 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPT1P50897 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPT1P50897 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPT1P50897 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPT1P50897 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPT1P50897 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPT1P50897 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPT1P50897 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPT1P50897 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPT1P50897 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPT1P50897 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPT1P50897 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPT1P50897 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPT1P50897 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPT1P50897 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPT1P50897 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPT1P50897 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPT1P50897 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPT1P50897 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPT1P50897 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPT1P50897 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPT1P50897 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPT1P50897 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPT1P50897 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPT1P50897 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPT1P50897 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPT1P50897 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPT1P50897 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PPT1P50897 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT1P50897 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT1P50897 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT1P50897 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT1P50897 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT1P50897 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT1P50897 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT1P50897 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT1P50897 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT1P50897 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT1P50897 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT1P50897 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT1P50897 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT1P50897 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT1P50897 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT1P50897 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT1P50897 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT1P50897 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT1P50897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT1P50897 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT1P50897 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT1P50897 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT1P50897 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT1P50897 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT1P50897 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT1P50897 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT1P50897 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms