Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PITPNBP48739 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNBP48739 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNBP48739 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms