Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGER1P34995 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER1P34995 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER1P34995 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER1P34995 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms