Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CLIP1P30622 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CLIP1P30622 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CLIP1P30622 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CLIP1P30622 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CLIP1P30622 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CLIP1P30622 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms