Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF8P28908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF8P28908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF8P28908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms