Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD34P28906 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD34P28906 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD34P28906 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD34P28906 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD34P28906 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD34P28906 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD34P28906 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD34P28906 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD34P28906 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD34P28906 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD34P28906 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD34P28906 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD34P28906 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD34P28906 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD34P28906 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD34P28906 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD34P28906 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD34P28906 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD34P28906 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD34P28906 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD34P28906 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD34P28906 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD34P28906 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD34P28906 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD34P28906 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD34P28906 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD34P28906 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD34P28906 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD34P28906 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD34P28906 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD34P28906 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD34P28906 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD34P28906 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD34P28906 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD34P28906 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD34P28906 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD34P28906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD34P28906 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD34P28906 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD34P28906 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD34P28906 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD34P28906 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD34P28906 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD34P28906 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD34P28906 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD34P28906 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD34P28906 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD34P28906 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD34P28906 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD34P28906 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD34P28906 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD34P28906 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD34P28906 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD34P28906 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD34P28906 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD34P28906 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD34P28906 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD34P28906 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD34P28906 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD34P28906 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD34P28906 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD34P28906 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD34P28906 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD34P28906 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD34P28906 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms