Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA3P25788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA3P25788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMA3P25788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms