Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP5A1P25705 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5A1P25705 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms