Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA4P22459 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA4P22459 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNA4P22459 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA4P22459 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNA4P22459 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNA4P22459 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA4P22459 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA4P22459 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA4P22459 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms