Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
VEGFAP15692 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
VEGFAP15692 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFAP15692 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
VEGFAP15692 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms