Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NID1P14543 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NID1P14543 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NID1P14543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NID1P14543 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NID1P14543 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NID1P14543 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NID1P14543 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NID1P14543 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NID1P14543 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NID1P14543 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NID1P14543 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NID1P14543 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NID1P14543 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NID1P14543 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NID1P14543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NID1P14543 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NID1P14543 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NID1P14543 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NID1P14543 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NID1P14543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NID1P14543 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NID1P14543 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NID1P14543 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NID1P14543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NID1P14543 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NID1P14543 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NID1P14543 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NID1P14543 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NID1P14543 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NID1P14543 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NID1P14543 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NID1P14543 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NID1P14543 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NID1P14543 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NID1P14543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NID1P14543 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NID1P14543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NID1P14543 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NID1P14543 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NID1P14543 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NID1P14543 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NID1P14543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NID1P14543 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NID1P14543 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NID1P14543 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NID1P14543 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NID1P14543 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NID1P14543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NID1P14543 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NID1P14543 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NID1P14543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NID1P14543 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NID1P14543 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NID1P14543 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NID1P14543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NID1P14543 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NID1P14543 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NID1P14543 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NID1P14543 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NID1P14543 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NID1P14543 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NID1P14543 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NID1P14543 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NID1P14543 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NID1P14543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NID1P14543 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NID1P14543 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NID1P14543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NID1P14543 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NID1P14543 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NID1P14543 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NID1P14543 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NID1P14543 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NID1P14543 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NID1P14543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NID1P14543 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NID1P14543 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms