Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT10P13645 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT10P13645 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT10P13645 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT10P13645 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT10P13645 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT10P13645 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT10P13645 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT10P13645 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT10P13645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT10P13645 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT10P13645 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT10P13645 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT10P13645 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT10P13645 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT10P13645 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT10P13645 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT10P13645 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT10P13645 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT10P13645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT10P13645 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT10P13645 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT10P13645 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT10P13645 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT10P13645 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT10P13645 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT10P13645 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT10P13645 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT10P13645 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT10P13645 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT10P13645 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT10P13645 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT10P13645 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT10P13645 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT10P13645 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT10P13645 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT10P13645 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT10P13645 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT10P13645 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT10P13645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT10P13645 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT10P13645 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT10P13645 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT10P13645 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT10P13645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT10P13645 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT10P13645 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT10P13645 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT10P13645 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT10P13645 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT10P13645 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT10P13645 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT10P13645 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT10P13645 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT10P13645 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT10P13645 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT10P13645 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT10P13645 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT10P13645 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT10P13645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT10P13645 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT10P13645 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT10P13645 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT10P13645 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT10P13645 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT10P13645 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT10P13645 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT10P13645 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT10P13645 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT10P13645 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT10P13645 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT10P13645 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT10P13645 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT10P13645 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT10P13645 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT10P13645 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT10P13645 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT10P13645 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT10P13645 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT10P13645 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT10P13645 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT10P13645 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT10P13645 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT10P13645 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT10P13645 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT10P13645 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT10P13645 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT10P13645 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms