Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB1P12018 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB1P12018 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms