Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GLI2P10070 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GLI2P10070 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
GLI2P10070 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GLI2P10070 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
GLI2P10070 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GLI2P10070 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GLI2P10070 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
GLI2P10070 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GLI2P10070 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
GLI2P10070 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
GLI2P10070 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
GLI2P10070 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GLI2P10070 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GLI2P10070 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GLI2P10070 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GLI2P10070 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GLI2P10070 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
GLI2P10070 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.05■■■■■ 4
GLI2P10070 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.05■■■■■ 4
GLI2P10070 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
GLI2P10070 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GLI2P10070 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GLI2P10070 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.02■■■■■ 4
GLI2P10070 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GLI2P10070 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GLI2P10070 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
GLI2P10070 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
GLI2P10070 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
GLI2P10070 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
GLI2P10070 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GLI2P10070 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
GLI2P10070 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
GLI2P10070 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GLI2P10070 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
GLI2P10070 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
GLI2P10070 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GLI2P10070 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GLI2P10070 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GLI2P10070 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GLI2P10070 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GLI2P10070 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
GLI2P10070 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
GLI2P10070 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GLI2P10070 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GLI2P10070 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GLI2P10070 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
GLI2P10070 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
GLI2P10070 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GLI2P10070 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GLI2P10070 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GLI2P10070 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
GLI2P10070 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GLI2P10070 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GLI2P10070 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GLI2P10070 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GLI2P10070 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GLI2P10070 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GLI2P10070 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GLI2P10070 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GLI2P10070 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
GLI2P10070 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GLI2P10070 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GLI2P10070 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
GLI2P10070 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GLI2P10070 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GLI2P10070 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GLI2P10070 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
GLI2P10070 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GLI2P10070 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GLI2P10070 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
GLI2P10070 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
GLI2P10070 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GLI2P10070 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GLI2P10070 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GLI2P10070 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GLI2P10070 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
GLI2P10070 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GLI2P10070 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
GLI2P10070 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
GLI2P10070 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
GLI2P10070 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GLI2P10070 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
GLI2P10070 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
GLI2P10070 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GLI2P10070 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GLI2P10070 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GLI2P10070 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GLI2P10070 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
GLI2P10070 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GLI2P10070 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
GLI2P10070 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms