Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKHD1P08F94 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PKHD1P08F94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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