Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NGFRP08138 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFRP08138 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFRP08138 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFRP08138 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFRP08138 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFRP08138 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFRP08138 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NGFRP08138 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NGFRP08138 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NGFRP08138 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NGFRP08138 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGFRP08138 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGFRP08138 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGFRP08138 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGFRP08138 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGFRP08138 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGFRP08138 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFRP08138 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFRP08138 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFRP08138 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFRP08138 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NGFRP08138 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NGFRP08138 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NGFRP08138 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NGFRP08138 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFRP08138 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFRP08138 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFRP08138 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFRP08138 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFRP08138 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFRP08138 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NGFRP08138 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NGFRP08138 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NGFRP08138 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NGFRP08138 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NGFRP08138 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NGFRP08138 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NGFRP08138 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NGFRP08138 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NGFRP08138 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFRP08138 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NGFRP08138 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NGFRP08138 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFRP08138 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFRP08138 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFRP08138 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFRP08138 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGFRP08138 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGFRP08138 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGFRP08138 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFRP08138 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFRP08138 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFRP08138 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFRP08138 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFRP08138 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGFRP08138 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGFRP08138 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGFRP08138 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGFRP08138 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGFRP08138 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGFRP08138 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGFRP08138 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFRP08138 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFRP08138 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NGFRP08138 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NGFRP08138 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NGFRP08138 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NGFRP08138 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms