Protein–RNA interactions for Protein: P00846

MT-ATP6, ATP synthase subunit a, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP6P00846 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ATP6P00846 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MT-ATP6P00846 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ATP6P00846 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms