Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
EGFRP00533 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EGFRP00533 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EGFRP00533 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EGFRP00533 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EGFRP00533 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EGFRP00533 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EGFRP00533 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EGFRP00533 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EGFRP00533 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EGFRP00533 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EGFRP00533 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EGFRP00533 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EGFRP00533 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EGFRP00533 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EGFRP00533 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EGFRP00533 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EGFRP00533 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EGFRP00533 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EGFRP00533 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EGFRP00533 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EGFRP00533 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EGFRP00533 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EGFRP00533 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EGFRP00533 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EGFRP00533 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EGFRP00533 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
EGFRP00533 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EGFRP00533 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EGFRP00533 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EGFRP00533 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EGFRP00533 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EGFRP00533 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EGFRP00533 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EGFRP00533 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EGFRP00533 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EGFRP00533 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EGFRP00533 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EGFRP00533 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EGFRP00533 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EGFRP00533 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EGFRP00533 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
EGFRP00533 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EGFRP00533 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EGFRP00533 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EGFRP00533 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EGFRP00533 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EGFRP00533 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EGFRP00533 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EGFRP00533 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EGFRP00533 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
EGFRP00533 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
EGFRP00533 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
EGFRP00533 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EGFRP00533 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
EGFRP00533 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EGFRP00533 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EGFRP00533 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EGFRP00533 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EGFRP00533 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EGFRP00533 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EGFRP00533 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EGFRP00533 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EGFRP00533 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EGFRP00533 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EGFRP00533 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EGFRP00533 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EGFRP00533 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EGFRP00533 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EGFRP00533 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EGFRP00533 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EGFRP00533 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EGFRP00533 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EGFRP00533 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EGFRP00533 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
EGFRP00533 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EGFRP00533 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EGFRP00533 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
EGFRP00533 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EGFRP00533 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EGFRP00533 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EGFRP00533 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EGFRP00533 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EGFRP00533 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EGFRP00533 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EGFRP00533 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EGFRP00533 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EGFRP00533 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EGFRP00533 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EGFRP00533 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EGFRP00533 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EGFRP00533 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EGFRP00533 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
EGFRP00533 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EGFRP00533 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
EGFRP00533 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EGFRP00533 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
EGFRP00533 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EGFRP00533 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EGFRP00533 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms