Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APC2O95996 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APC2O95996 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APC2O95996 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APC2O95996 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APC2O95996 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APC2O95996 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APC2O95996 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APC2O95996 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APC2O95996 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APC2O95996 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APC2O95996 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APC2O95996 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APC2O95996 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APC2O95996 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APC2O95996 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APC2O95996 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APC2O95996 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APC2O95996 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APC2O95996 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APC2O95996 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APC2O95996 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APC2O95996 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APC2O95996 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APC2O95996 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APC2O95996 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APC2O95996 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APC2O95996 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APC2O95996 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APC2O95996 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APC2O95996 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APC2O95996 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APC2O95996 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APC2O95996 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APC2O95996 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APC2O95996 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APC2O95996 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APC2O95996 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APC2O95996 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APC2O95996 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APC2O95996 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APC2O95996 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APC2O95996 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APC2O95996 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APC2O95996 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APC2O95996 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APC2O95996 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APC2O95996 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APC2O95996 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APC2O95996 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APC2O95996 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APC2O95996 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APC2O95996 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APC2O95996 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APC2O95996 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APC2O95996 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APC2O95996 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APC2O95996 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APC2O95996 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APC2O95996 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APC2O95996 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APC2O95996 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APC2O95996 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APC2O95996 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APC2O95996 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APC2O95996 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APC2O95996 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APC2O95996 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APC2O95996 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APC2O95996 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APC2O95996 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APC2O95996 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APC2O95996 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APC2O95996 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APC2O95996 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APC2O95996 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APC2O95996 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APC2O95996 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APC2O95996 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APC2O95996 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APC2O95996 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APC2O95996 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APC2O95996 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APC2O95996 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APC2O95996 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APC2O95996 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms