Protein–RNA interactions for Protein: O95872

GPANK1, G patch domain and ankyrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPANK1O95872 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms