Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRD1O95696 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRD1O95696 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRD1O95696 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRD1O95696 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRD1O95696 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRD1O95696 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD1O95696 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD1O95696 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD1O95696 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD1O95696 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD1O95696 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRD1O95696 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRD1O95696 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRD1O95696 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRD1O95696 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRD1O95696 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRD1O95696 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRD1O95696 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRD1O95696 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRD1O95696 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRD1O95696 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRD1O95696 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRD1O95696 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRD1O95696 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRD1O95696 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRD1O95696 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRD1O95696 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRD1O95696 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD1O95696 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD1O95696 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD1O95696 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD1O95696 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD1O95696 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRD1O95696 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BRD1O95696 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BRD1O95696 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRD1O95696 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD1O95696 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD1O95696 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD1O95696 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD1O95696 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD1O95696 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD1O95696 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD1O95696 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD1O95696 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD1O95696 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD1O95696 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRD1O95696 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRD1O95696 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRD1O95696 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRD1O95696 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRD1O95696 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRD1O95696 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRD1O95696 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRD1O95696 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BRD1O95696 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRD1O95696 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRD1O95696 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRD1O95696 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRD1O95696 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BRD1O95696 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRD1O95696 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRD1O95696 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRD1O95696 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRD1O95696 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRD1O95696 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRD1O95696 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRD1O95696 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BRD1O95696 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRD1O95696 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
BRD1O95696 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BRD1O95696 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD1O95696 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRD1O95696 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRD1O95696 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRD1O95696 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BRD1O95696 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRD1O95696 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRD1O95696 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRD1O95696 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRD1O95696 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRD1O95696 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRD1O95696 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRD1O95696 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRD1O95696 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRD1O95696 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
BRD1O95696 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms