Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB6O95452 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB6O95452 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB6O95452 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB6O95452 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB6O95452 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB6O95452 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB6O95452 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB6O95452 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB6O95452 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB6O95452 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB6O95452 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB6O95452 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB6O95452 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB6O95452 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB6O95452 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB6O95452 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB6O95452 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB6O95452 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB6O95452 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB6O95452 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB6O95452 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB6O95452 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB6O95452 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB6O95452 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB6O95452 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB6O95452 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB6O95452 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB6O95452 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB6O95452 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB6O95452 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB6O95452 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB6O95452 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB6O95452 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJB6O95452 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJB6O95452 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB6O95452 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB6O95452 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB6O95452 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB6O95452 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB6O95452 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB6O95452 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB6O95452 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB6O95452 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB6O95452 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB6O95452 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB6O95452 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB6O95452 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB6O95452 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB6O95452 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB6O95452 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB6O95452 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB6O95452 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB6O95452 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB6O95452 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB6O95452 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB6O95452 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB6O95452 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB6O95452 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB6O95452 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB6O95452 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB6O95452 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB6O95452 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB6O95452 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB6O95452 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB6O95452 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB6O95452 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB6O95452 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB6O95452 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB6O95452 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB6O95452 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB6O95452 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB6O95452 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB6O95452 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB6O95452 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB6O95452 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB6O95452 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB6O95452 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB6O95452 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB6O95452 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB6O95452 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB6O95452 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB6O95452 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB6O95452 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB6O95452 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB6O95452 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB6O95452 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms