Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL3O95164 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL3O95164 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL3O95164 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL3O95164 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL3O95164 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL3O95164 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL3O95164 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL3O95164 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL3O95164 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL3O95164 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL3O95164 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL3O95164 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL3O95164 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL3O95164 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL3O95164 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL3O95164 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBL3O95164 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL3O95164 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL3O95164 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL3O95164 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL3O95164 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL3O95164 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL3O95164 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL3O95164 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL3O95164 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL3O95164 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL3O95164 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL3O95164 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL3O95164 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL3O95164 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL3O95164 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL3O95164 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL3O95164 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL3O95164 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL3O95164 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL3O95164 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL3O95164 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL3O95164 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL3O95164 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL3O95164 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL3O95164 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL3O95164 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL3O95164 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL3O95164 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL3O95164 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL3O95164 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL3O95164 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL3O95164 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL3O95164 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL3O95164 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL3O95164 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL3O95164 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL3O95164 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBL3O95164 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL3O95164 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL3O95164 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL3O95164 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL3O95164 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL3O95164 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL3O95164 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL3O95164 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL3O95164 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL3O95164 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL3O95164 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL3O95164 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL3O95164 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL3O95164 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL3O95164 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL3O95164 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL3O95164 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL3O95164 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL3O95164 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL3O95164 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL3O95164 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL3O95164 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL3O95164 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms