Protein–RNA interactions for Protein: O75771

RAD51D, DNA repair protein RAD51 homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51DO75771 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51DO75771 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51DO75771 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD51DO75771 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51DO75771 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms