Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM3O75382 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM3O75382 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM3O75382 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM3O75382 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM3O75382 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM3O75382 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM3O75382 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM3O75382 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM3O75382 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM3O75382 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms